前作までは、奪ったガンプラパーツはバトル終了後のカスタマイズパートで組み替えを行っていたが、
本作はバトル中でも換装が可能！
欲しいパーツが手に入ったらその場で装着しよう！
本作はガンプラパーツ１つ１つにEXスキルがついているため、頭、胴、腕、脚、バックパック、盾の“最大6つ”のEXスキルをバトル中に扱うことができる。バトル中、レベルが上がると扱えるEXスキルが解放されていく仕組みだ！
画面右下に扱えるEXスキルが表示されている。頭、胴、腕、脚、バックパック、盾にそれぞれEXスキルが紐づく。
レベルが上がるたびにLOCKが外れ、EXスキルが使用可能に！バトルが始まったら敵を倒して早めにレベルを上げよう！
ガンダムの胴パーツから、強力なサザビーの胴パーツにカスタマイズ！敵から奪ったパーツのEXスキルが強力だったら、逆にそれを活用してしまおう！
ガンダムブレイカーに登場する敵は、1/144や1/100スケールのMS（モビルスーツ）だけではなく、MA（モビルアーマー）や巨大戦艦なども登場する！
本作から登場する巨大な敵とその脅威を紹介！
不規則に動き回るワイヤーブレードや突如召喚されるプルーマによる突進攻撃など、距離問わず動きが読みにくい厄介な敵。
残りのHPによってビーム照射が強力になってくるので、迂闊に近寄らずに相手の動きを見ながら一瞬の隙を狙って攻撃しよう！
プレイヤーがジャンプをしても届かない高さで浮遊しながら「GNキャノン」を放ってくる小憎らしい敵。
相手の攻撃に注意しながら射撃武器で地道に攻撃を与えてもいいが、低空飛行に切り替わるタイミングがあるため、パターンを読みながら臨機応変に攻撃を変えることで早期攻略を狙おう！
